第3期SSHでは、第1～2期でのSSH研究開発の方向性を継承し、「女性研究者育成」に主眼を置いた、中高一貫校としての教育開発を行ってきました。高校で進めてきた高大連携実習や課題研究活動を充実させ、中学校における海外研修や自然環境学習、理科の授業内で行われる課題研究活動などは、第3期で特に注力してきたプログラムです。
また、先端科学・グローバル・ESDという三本柱を立て、科学教育において、持続可能な開発の視点も入れたプログラムも充実させました。特に学校設定科目「グリーンサイエンス」では、外来種問題を扱った探究活動を行い、自ら得られたデータでもって環境問題を議論する活動も行いました。
全国規模で行ってきた「集まれ！理系女子　女子生徒による科学研究発表交流会」は全国大会とは別に地方大会を行うなど、開催規模を広げ、参加者の倍増にもつなげることができました。